目前,DIA 技术作为蛋白质组学定量技术的主流之选,其运用独特的 Data Independent Acquisition(数据非依赖采集)技术来采集数据。相较于传统的数据依赖扫描模式(DDA),DIA 方法展现出卓越的特性。它拥有更出色的重复性,能确保实验结果的稳定与可靠;具备更高的蛋白覆盖率,如同编织了一张更为细密的网,捕捉更多蛋白质信息;还拥有令人称赞的定量准确度。也正因如此,在诸如标志物研究、疾病精准分型以及品系比较等需要大规模样本分析的领域中,DIA 成为了科研人员优先考量的前沿技术。
产品定义
DIA 技术是目前主流的蛋白质组学定量技术,它采用DIA(Data Independent Acquisition,数据非依赖采集)技术进行数据采集,将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级 MS 扫描再进行二级 MS/MS 分析。因此,DIA 能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。 DIA 综合了 shotgun proteomics 高通量检测的特点与精准定量分析的优势,是真正意义上的全扫描质谱检测手段。
技术路线
DIA先提取样品中总蛋白,取出一部分做蛋白浓度测定及 SDS-PAGE 检测,另取部分进行胰蛋白酶酶解,对酶解肽段除盐之后,对样品进行 LC-MS/MS 鉴定。LC-MS/MS 鉴定分为两个主要步骤,第一步采用传统的 DDA 方法建立蛋白谱图库或者直接使用软件搜库,第二步采用 DIA 技术采集每个样品的质谱数据,在 DDA 数据库的基础上进行谱图匹配、定量信息的提取以及后续统计分析等。
技术优势
与其它传统定量技术相比,DIA 技术具有非常明显的优势。
1)与 Label-free(非标记定量)技术相比:
Label-free 技术采用的是 DDA 数据采集模式,因而其具有 DDA 固有的缺陷——低丰度蛋白鉴定重复性差,Cycle Time 变化大等;而且 Label-free 采用 MS1 质谱信息进行蛋白质定量,易受基质干扰,定量结果准确性较差。
2)与 ITRAQ/TMT 技术相比:
ITRAQ/TMT技术采用的也是 DDA 数据采集模式,同样具有 DDA 固有的缺陷;同时 ITRAQ/TMT 技术在样本基质复杂时,易受到其他多肽的报告离子的干扰,导致定量结果存在比值压缩的缺点, 定量结果准确性不高。
与数据依赖扫描模式(DDA)相比,DIA方法具有更好的重复性、更高的蛋白覆盖率和定量准确度,特别适用于大样本的研究。
应用领域
01药物研发
DIA技术可用于药物代谢动力学研究、药物靶点鉴定和药物剂量优化,提高药物研发效率和准确性。
02疾病研究
在癌症研究中,DIA技术可揭示肿瘤细胞的变化及其对治疗的响应,同时也可用于研究其他疾病的生物标志物和蛋白质相互作用网络。
03生物医学研究
DIA技术有助于理解修饰在细胞功能和疾病发生发展中的作用机制,为生物医学领域的发展做出贡献。
结果展示
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